乙肝病毒感染后的免疫耐受期，通常发生在幼年期到青少年期这段时间。免疫耐受，大致能够解释为基本上没有身体的临床症状，同时没有肝功能、血清HBV-DNA的波动、无肝组织学实质损害或无明显损害。
客观理解免疫耐受期，密切监测乙肝，DNA高载量不容忽视
许多青少年的乙肝感染者，都是无症状乙肝病毒携带者，所以在这个时期通常不需要过度治疗，抗病毒药物效果也不理想，也不可能根治肝细胞核内的乙肝病毒。免疫耐受的意思是，身体的免疫细胞发育还不够健全，无法识别并发起清除乙肝病毒，即无法产生免疫反应。这时，免疫细胞把乙肝病毒当成身体的一部分，即免疫耐受期。
处在这个时期的“乙肝大三阳”、“乙肝小三阳”，都是不需要保肝或抗病毒治疗的，所以免疫耐受时期也容易被忽视，忽视定期监测体内乙肝的进展情况。身体的免疫细胞与乙肝病毒保持“和平相处”，但是并不表示乙肝病毒已经停止复制，这一点可以通过血清HBV-DNA阳性，进一步判断出来。
DNA病毒阳性，充分说明体内乙肝病毒复制水平是活跃的，继续波及未感染的肝细胞。所以，对于无症状乙肝慢性携带状态时，往往只是轻微肝损害，DNA病毒却长期保持高载量，这是今后导致免疫反应的原因之一。是否应该存在“乙肝大三阳”或者“乙肝小三阳”更适合使用抗病毒药物的说法呢？
小番健康提醒，其实这种说法比较不严谨，乙肝两对半主要目的是明确体内是否携带乙肝病毒，不用来判断肝病轻重以及药物疗效。对于大多数的无症状乙肝携带者，即乙肝病毒携带者而言，他们短期内可以不用抗病毒药物，但是应该定期监测体内乙肝病毒复制水平。
无症状乙肝携带者，可以包括大三阳、小三阳、小二阳以及大一阳这些类型，但是只要没有找到肝炎活动依据，或机体已经发生免疫反应的证据，就不宜轻易启动抗病毒药物治疗。为什么有的地方，又提倡血清HBV-DNA长期阳性，属于母婴垂直传播感染者或乙肝导致肝癌家族病史，应该提早进行抗病毒呢？这其实一种预防措施。
因为随着医药学进步，目前已发现的从乙肝病毒携带者发展到乙肝患者这部分人群里，多数是属于母婴垂直传播感染者，所以母婴传播是导致日后难治愈的另一个原因之一。有上面这种特殊情况，除了肝功能基本正常，没有任何临床症状，只有血清HBV-DNA阳性时，属于母婴垂直传播这条感染途径，有时会被建议进行肝穿刺检查。
根本原因是，长期的血清HBV-DNA高病毒载量，是对肝脏健康的隐患，提早通过核苷类药物（NAs）使用可以强效抑制乙肝病毒复制，促使血清HBV-DNA检测不到，进一步降低母婴传播的乙肝病毒携带者今后发展到乙肝患者几率。